Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORAP35398 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORAP35398 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORAP35398 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORAP35398 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RORAP35398 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RORAP35398 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RORAP35398 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RORAP35398 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RORAP35398 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RORAP35398 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RORAP35398 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RORAP35398 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RORAP35398 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RORAP35398 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms