Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA4P35212 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GJA4P35212 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GJA4P35212 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms