Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP6P35125 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP6P35125 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP6P35125 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP6P35125 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP6P35125 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP6P35125 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP6P35125 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
USP6P35125 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP6P35125 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP6P35125 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP6P35125 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms