Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GDI1P31150 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDI1P31150 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDI1P31150 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDI1P31150 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GDI1P31150 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms