Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TSPOP30536 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms