Protein–RNA interactions for Protein: P30405

PPIF, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPIFP30405 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPIFP30405 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPIFP30405 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPIFP30405 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PPIFP30405 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms