Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CD40LGP29965 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CD40LGP29965 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD40LGP29965 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms