Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PLNP26678 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PLNP26678 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
PLNP26678 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms