Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
POLR2AP24928 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR2AP24928 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms