Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PTPRBP23467 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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