Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PDE6GP18545 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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