Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CTLA4P16410 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTLA4P16410 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTLA4P16410 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms