Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CREB1P16220 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CREB1P16220 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms