Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DMDP11532 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DMDP11532 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DMDP11532 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DMDP11532 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DMDP11532 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms