Protein–RNA interactions for Protein: P0C0E4

RAB40AL, Ras-related protein Rab-40A-like, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40ALP0C0E4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB40ALP0C0E4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB40ALP0C0E4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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