Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRCP08575 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRCP08575 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRCP08575 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRCP08575 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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