Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LYNP07948 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LYNP07948 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LYNP07948 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms