Protein–RNA interactions for Protein: P05305

EDN1, Endothelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDN1P05305 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
EDN1P05305 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
EDN1P05305 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
EDN1P05305 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms