Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLIT2O94813 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms