Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HOXA3O43365 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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