Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF208O43345 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms