Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APAF1O14727 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APAF1O14727 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APAF1O14727 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms