Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
BHLHE40O14503 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
BHLHE40O14503 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms