Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOC4-APOC2K7ER74 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms