Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC01387J3KSC0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC01387J3KSC0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms