Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BHMG1C9JSJ3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BHMG1C9JSJ3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms