Protein–RNA interactions for Protein: A8MUA0

Putative UPF0607 protein ENSP00000381514, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MUA0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MUA0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MUA0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MUA0 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MUA0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MUA0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A8MUA0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A8MUA0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A8MUA0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
A8MUA0 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms