Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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