Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDR42E2A6NKP2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms