Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRAMEF22A3QJZ6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms