Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC144AA2RUR9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms