Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y696

CLIC4, Chloride intracellular channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC4Q9Y696 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIC4Q9Y696 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIC4Q9Y696 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC4Q9Y696 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms