Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNX11Q9Y5W9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX11Q9Y5W9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms