Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
R3HCC1Q9Y3T6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
R3HCC1Q9Y3T6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
R3HCC1Q9Y3T6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
R3HCC1Q9Y3T6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms