Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K2

SIK3, Serine/threonine-protein kinase SIK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK3Q9Y2K2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIK3Q9Y2K2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIK3Q9Y2K2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIK3Q9Y2K2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms