Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQQ2

SH2B3, SH2B adapter protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B3Q9UQQ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SH2B3Q9UQQ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH2B3Q9UQQ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH2B3Q9UQQ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms