Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ84

EXO1, Exonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO1Q9UQ84 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXO1Q9UQ84 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EXO1Q9UQ84 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXO1Q9UQ84 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms