Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPT9

USP22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22Q9UPT9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP22Q9UPT9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP22Q9UPT9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP22Q9UPT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms