Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHF8Q9UPP1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PHF8Q9UPP1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PHF8Q9UPP1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms