Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCAF8Q9UPN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAF8Q9UPN6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SCAF8Q9UPN6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SCAF8Q9UPN6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms