Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SNX7Q9UNH6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX7Q9UNH6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX7Q9UNH6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms