Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM19

HPCAL4, Hippocalcin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL4Q9UM19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
HPCAL4Q9UM19 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HPCAL4Q9UM19 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HPCAL4Q9UM19 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPCAL4Q9UM19 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HPCAL4Q9UM19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAL4Q9UM19 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAL4Q9UM19 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAL4Q9UM19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HPCAL4Q9UM19 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms