Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Length 816 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TPCN1Q9ULQ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TPCN1Q9ULQ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TPCN1Q9ULQ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TPCN1Q9ULQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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