Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SALL4Q9UJQ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SALL4Q9UJQ4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SALL4Q9UJQ4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SALL4Q9UJQ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209.7 ms