Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RABGEF1Q9UJ41 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RABGEF1Q9UJ41 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RABGEF1Q9UJ41 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RABGEF1Q9UJ41 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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