Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HERC5Q9UII4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
HERC5Q9UII4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HERC5Q9UII4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HERC5Q9UII4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms