Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CPA4Q9UI42 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CPA4Q9UI42 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CPA4Q9UI42 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CPA4Q9UI42 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms