Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRPS1Q9UHF7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRPS1Q9UHF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRPS1Q9UHF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRPS1Q9UHF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms