Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHORDC1Q9UHD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHORDC1Q9UHD1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHORDC1Q9UHD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHORDC1Q9UHD1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms