Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CDKN2A-AS1Q9UH64 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms